144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3212 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  63.81 
 
 		 572 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  65.57 
 
 		 572 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  66.38 
 
 		 572 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  100 
 
 		 578 aa  1139    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  64.24 
 
 		 572 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  64.52 
 
 		 571 aa  642    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  63.22 
 
 		 572 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  61.32 
 
 		 588 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  60.45 
 
 		 577 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  57.87 
 
 		 586 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  58.46 
 
 		 585 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 664 aa  295  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  37.92 
 
 		 612 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  37.35 
 
 		 579 aa  273  6e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 647 aa  267  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  31.72 
 
 		 607 aa  236  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  32.37 
 
 		 658 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 679 aa  231  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  37.05 
 
 		 646 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  36.75 
 
 		 701 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 644 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  27.61 
 
 		 667 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 612 aa  211  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  32.26 
 
 		 531 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 663 aa  210  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.57 
 
 		 517 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  33.33 
 
 		 599 aa  206  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  30.72 
 
 		 544 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 690 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 690 aa  204  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 701 aa  203  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 650 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 692 aa  200  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  31.38 
 
 		 690 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 681 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 687 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 		 692 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  31.52 
 
 		 601 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  30.82 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 587 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  34.18 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 680 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 		 693 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 657 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 533 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 653 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  29.19 
 
 		 576 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 693 aa  171  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 		 691 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  31.97 
 
 		 503 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  27.53 
 
 		 573 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  27.75 
 
 		 573 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  27.52 
 
 		 573 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  29.45 
 
 		 310 aa  125  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  28.22 
 
 		 310 aa  120  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.16 
 
 		 611 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  25.78 
 
 		 564 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  30.04 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  37.64 
 
 		 304 aa  102  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  27.23 
 
 		 595 aa  96.7  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 		 220 aa  94  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  26.28 
 
 		 651 aa  88.2  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  42.72 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  42.72 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 		 273 aa  76.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  26.01 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  22.01 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  24.13 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  27.27 
 
 		 339 aa  70.1  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  22.11 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 301 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  22.28 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  27.96 
 
 		 334 aa  67  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  23.98 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.24 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.27 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  30.61 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  46.25 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 312 aa  62  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  30.04 
 
 		 344 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  26.13 
 
 		 344 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0461  hypothetical protein  47.44 
 
 		 224 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  24.62 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  25.22 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  26.27 
 
 		 336 aa  57  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  22.51 
 
 		 333 aa  57  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  21.01 
 
 		 754 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  21.89 
 
 		 328 aa  54.3  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  28.97 
 
 		 339 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  28.41 
 
 		 311 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  22.89 
 
 		 334 aa  53.9  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 		 340 aa  53.5  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 329 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  25.29 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>