More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2653 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2653  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 391 aa  763    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  39.47 
 
 		 372 aa  195  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  39.47 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  38.92 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.92 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  38.08 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  35.93 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  36.41 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  36.75 
 
 		 369 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.13 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  36.89 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  38.04 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.9 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.25 
 
 		 357 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  36.25 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.03 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  33.71 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  38.64 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  37 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.71 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  40.07 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  35.28 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.76 
 
 		 361 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.31 
 
 		 395 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.41 
 
 		 362 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  36.52 
 
 		 363 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  37.83 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.42 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  32.2 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  36.36 
 
 		 361 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 		 372 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  33.03 
 
 		 372 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  33.99 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  35.2 
 
 		 354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.87 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.54 
 
 		 377 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  33.02 
 
 		 368 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  33.63 
 
 		 355 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  33.23 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.34 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.64 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  32.72 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  33.97 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  31.85 
 
 		 355 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.71 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  28.86 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.32 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  32.23 
 
 		 357 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  30.74 
 
 		 366 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  30.07 
 
 		 367 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  33.53 
 
 		 357 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.74 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  30.07 
 
 		 367 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.37 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  32.36 
 
 		 356 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  35.44 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.73 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  29.26 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  31.89 
 
 		 394 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  29.68 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  32.34 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.66 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  31.7 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  30.56 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  32.03 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.21 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.88 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46580  putative multidrug efflux gene product  32.08 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561033  hitchhiker  0.00000166961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.54 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0999  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  31.97 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  31.39 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  34.2 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  30.24 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  31.35 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.32 
 
 		 368 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  30.6 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.51 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  30.97 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  29.64 
 
 		 405 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6139  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 374 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.92 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  29.97 
 
 		 369 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 		 369 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  30.85 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  31.03 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  30.38 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  30.45 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.48 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1298  secretion protein HlyD  34.25 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6532  RND family efflux transporter MFP subunit  34.25 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  29.75 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.58 
 
 		 371 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  29.61 
 
 		 405 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3206  transport lipoprotein  33.71 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443249  normal  0.0512525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>