265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1050 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  100 
 
 		 284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  63.38 
 
 		 283 aa  361  7.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  58.25 
 
 		 284 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  58.25 
 
 		 284 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  57.54 
 
 		 284 aa  326  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  56.49 
 
 		 285 aa  316  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  51.76 
 
 		 283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  51.41 
 
 		 283 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  55.75 
 
 		 283 aa  275  8e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  49.82 
 
 		 312 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  47.37 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  49.3 
 
 		 285 aa  260  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  49.12 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  47.54 
 
 		 281 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  46.9 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  40.56 
 
 		 287 aa  217  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  40.56 
 
 		 287 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  40.56 
 
 		 287 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  41.4 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  41.05 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  37.19 
 
 		 284 aa  201  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  36.62 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  37.68 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  35.69 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  36.59 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  37.15 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  36.81 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  35.69 
 
 		 281 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  35.56 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  37.5 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  27.66 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  27.59 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  27.93 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  25.7 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  24.4 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  31.93 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  40.35 
 
 		 126 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  29.82 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  31.55 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  29.15 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  31.36 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.24 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  28.7 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  29.14 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  29.14 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  28.07 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  27.93 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  18.73 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  28.47 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  32.82 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  32.74 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.94 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  30.18 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  27.78 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  28.41 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1621  UspA domain protein  25.17 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  32.59 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  32.67 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  30.29 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  31.76 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  24.15 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  32.21 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  31.54 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  29.53 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.5 
 
 		 150 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  31.25 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 137 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  23.97 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.98 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  23.97 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.75 
 
 		 128 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  31.97 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  30.87 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  23.97 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  23.97 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  23.97 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  23.97 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.97 
 
 		 143 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  30.07 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  31.08 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  33.11 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  31.71 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  29.02 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 137 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  22.46 
 
 		 139 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  24.32 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>