More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0811 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  100 
 
 		 157 aa  314  4e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  86.62 
 
 		 157 aa  274  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  59.12 
 
 		 157 aa  180  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  33.54 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.17 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  30 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.78 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.78 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.04 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.78 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  40.21 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  48.53 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  32.69 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.63 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  37.65 
 
 		 201 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  42.86 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  30 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  35 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  38.96 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.25 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  32.28 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  35.16 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.19 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  31 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.8 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.62 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40.62 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  28.21 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  48.39 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.62 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.62 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.46 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.62 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  28.4 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  33.67 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  38.82 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  28.12 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  27.54 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.71 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  29.75 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  41.79 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.81 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  42.37 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  27.34 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  32.95 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  42.86 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  39.24 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  42.86 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  26.97 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  28.69 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  26.97 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  29.51 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  30.3 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  37.8 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  26.38 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  27 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  43.1 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  29.03 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.15 
 
 		 214 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  35.14 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  26.56 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  34.62 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  36.17 
 
 		 222 aa  51.6  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  43.08 
 
 		 130 aa  51.2  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  36.23 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  36.23 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.75 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  34.95 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  41.67 
 
 		 199 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  37.63 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  46.67 
 
 		 192 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  38.1 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.55 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  47.37 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  51.16 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  27.66 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  41.27 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  35.53 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  34.72 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  48.72 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  30.34 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  31.46 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  28.35 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.44 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  37.31 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.98 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  39.47 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  46.15 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  34.33 
 
 		 186 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  34.85 
 
 		 186 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.4 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.17 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  40.68 
 
 		 186 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.71 
 
 		 167 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.63 
 
 		 203 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.68 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.61 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  43.28 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  43.28 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>