More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4716 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 458 aa  946    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  54.59 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  54.3 
 
 		 453 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  54.53 
 
 		 453 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  30.66 
 
 		 470 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  31.11 
 
 		 466 aa  179  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  29.55 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  29.54 
 
 		 449 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  28.09 
 
 		 449 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  28.86 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  31.22 
 
 		 679 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  33.08 
 
 		 563 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.88 
 
 		 2156 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  30.31 
 
 		 914 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  29.25 
 
 		 688 aa  128  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  32.47 
 
 		 661 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  33.12 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  26.86 
 
 		 722 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  29.43 
 
 		 605 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  28.68 
 
 		 566 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  26.26 
 
 		 596 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  29.56 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  32.34 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  26.85 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  27.84 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  29.07 
 
 		 612 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  28.53 
 
 		 722 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  28.23 
 
 		 551 aa  107  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  26.33 
 
 		 707 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  26.53 
 
 		 738 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  28.66 
 
 		 494 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  29.05 
 
 		 623 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  27.67 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  24.11 
 
 		 614 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.21 
 
 		 1888 aa  92.4  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  29.63 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  28.62 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  26.6 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  29.62 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.27 
 
 		 1891 aa  80.1  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  28.67 
 
 		 1021 aa  77.8  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  28.31 
 
 		 552 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  25.69 
 
 		 620 aa  75.5  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2394  cytoplasmic alpha-amylase  26.38 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  24.41 
 
 		 559 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  27.78 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  22.31 
 
 		 750 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  27.98 
 
 		 555 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  29.13 
 
 		 555 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  25.6 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  26.65 
 
 		 814 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  27.42 
 
 		 606 aa  70.5  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  27.42 
 
 		 606 aa  70.5  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  25.49 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  23.41 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  30.19 
 
 		 836 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  29.35 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  28.87 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  22.05 
 
 		 613 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  22.08 
 
 		 750 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  22.05 
 
 		 613 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18730  cytoplasmic alpha-amylase  25.97 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  30.65 
 
 		 554 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  25.44 
 
 		 1017 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  25.89 
 
 		 925 aa  67  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  30.65 
 
 		 554 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  30.65 
 
 		 554 aa  67  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  30.65 
 
 		 554 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8729  alpha amylase catalytic region  26.91 
 
 		 441 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.150253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  30.65 
 
 		 554 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  25.09 
 
 		 575 aa  67  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  30.65 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  30.65 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02410  alpha amylase  25.38 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  31.97 
 
 		 555 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  25.39 
 
 		 723 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.79 
 
 		 1855 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  28.06 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1537  cytoplasmic alpha-amylase  28.51 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0143259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  26.71 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.57 
 
 		 1975 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  26.03 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0631  cytoplasmic alpha-amylase  23.78 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  25.78 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  25.69 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  26.8 
 
 		 545 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.58 
 
 		 1005 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  32.12 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  30.11 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0554  alpha amylase, catalytic region  25.48 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0002426  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2808  alpha amylase catalytic region  25.3 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00730774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  27.73 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  26.89 
 
 		 572 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  25.79 
 
 		 642 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25.91 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.47 
 
 		 2638 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  29.59 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  29.58 
 
 		 541 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  25.3 
 
 		 623 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>