118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51890 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  273  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  93.33 
 
 
135 aa  256  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  77.04 
 
 
137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  47.79 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  46.72 
 
 
142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  45.26 
 
 
143 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  45.26 
 
 
142 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  46.72 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  55.43 
 
 
151 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 
169 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  40.3 
 
 
152 aa  103  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  46.43 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  44.85 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  44.85 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  43.75 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  40.44 
 
 
147 aa  95.9  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  48.67 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  48.39 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  49.56 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  39.69 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  52.25 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  50.45 
 
 
145 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  45.54 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  43.28 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  47.96 
 
 
150 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  43.28 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  50.54 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  39.26 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  39.26 
 
 
141 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  45.19 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  43.48 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  43.48 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  45.19 
 
 
143 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  39.13 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  37.39 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  33.6 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  32.09 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  32.09 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  32.8 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  32.8 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  32.09 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  32.09 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  32.8 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  38.38 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  38.38 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  38.38 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  38.38 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  38.38 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  38.38 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  31.09 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  31.93 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  30.37 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  35.04 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1582  phenylacetic acid degradation-like protein  28.69 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000511967  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
150 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  29.09 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  26.27 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  26.27 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
154 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  34.02 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  35.35 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  30.56 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  31.48 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  32.17 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  31.63 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  25.19 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
147 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
127 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  35.71 
 
 
154 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  30.93 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  32.99 
 
 
147 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
127 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>