181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  100 
 
 		 515 aa  1010    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.42 
 
 		 486 aa  203  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 516 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  31.72 
 
 		 487 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3284  purine catabolism PurC-like protein  30.8 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0796347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3295  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.02 
 
 		 492 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.159277 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3346  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.02 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.728632  normal  0.0930873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  28.69 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  28.24 
 
 		 512 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  29.98 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  25.25 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  23.92 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1854  purine catabolism PurC domain-containing protein  28.19 
 
 		 501 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0691  helix-turn-helix, Fis-type  30.64 
 
 		 486 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.819144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  26.74 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5017  transcriptional regulator, PucR family  30.47 
 
 		 510 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  27.62 
 
 		 505 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1111  hypothetical protein  32.13 
 
 		 328 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  41.27 
 
 		 504 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1795  helix-turn-helix, Fis-type  33.73 
 
 		 519 aa  95.1  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  38.96 
 
 		 558 aa  94.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 517 aa  93.2  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4959  transcriptional regulator, PucR family  39.76 
 
 		 598 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0495  transcriptional regulator, PucR family  27.63 
 
 		 492 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579171  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0057  putative regulatory protein  28.83 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0293617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 535 aa  75.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3231  PucR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 586 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1307  transcriptional regulator, PucR family  31.16 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  46.34 
 
 		 514 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0685  CdaR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.217307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 552 aa  72  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3382  transcriptional regulator, PucR family  35.33 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3007  purine catabolism PurC domain-containing protein  35.22 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2065  transcriptional regulator, PucR family  32.57 
 
 		 549 aa  71.2  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  35.54 
 
 		 557 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7828  transcriptional regulator, PucR family  33.83 
 
 		 483 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  43.75 
 
 		 525 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  31.05 
 
 		 558 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  46.48 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3668  transcriptional regulator, CdaR  32.68 
 
 		 534 aa  67.8  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2103  transcriptional regulator, PucR family  31.48 
 
 		 536 aa  67.8  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  43.75 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  34.4 
 
 		 536 aa  67.4  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1880  PucR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 235 aa  67  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  32.69 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1035  PucR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 502 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0689331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  38.14 
 
 		 425 aa  66.6  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  43.84 
 
 		 543 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  32.45 
 
 		 575 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.1 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  47.06 
 
 		 561 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1941  transcriptional regulator, CdaR  32.79 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  34.34 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3368  hypothetical protein  58.49 
 
 		 90 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1869  transcriptional regulator, PucR family  35.25 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0319  transcriptional regulator, CdaR  34.62 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  34.92 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0764  putative transcriptional regulator, PucR family  36.43 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.829875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  26.04 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  37.11 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  41.03 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  29.52 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0861  transcriptional regulator, CdaR  37.17 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.975541  normal  0.0962087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  33.75 
 
 		 518 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0349  purine catabolism PurC-like protein  35.4 
 
 		 542 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  38.26 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0359  Fis family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 542 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0338  Fis family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 542 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  27.34 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1722  transcriptional regulator, PucR family  31.72 
 
 		 502 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 405 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  26.77 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  31.73 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1423  transcriptional regulator, PucR family  32.19 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.168591  normal  0.788034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  37.82 
 
 		 389 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2260  purine catabolism PurC-like protein  31.47 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.37592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2307  purine catabolism PurC domain-containing protein  31.47 
 
 		 412 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  44.07 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 405 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  32 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  29.7 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0566  transcriptional regulator, PucR family  29.85 
 
 		 532 aa  54.3  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  32 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.7 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  32 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  32 
 
 		 410 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2240  transcriptional regulator, PucR family  34.41 
 
 		 531 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0227847  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2299  CdaR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 412 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.646328  normal  0.691516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 477 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3278  PucR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.698814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3298  transcriptional regulator, CdaR  36.36 
 
 		 582 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  28.35 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  31.82 
 
 		 404 aa  52.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  42.11 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  40.35 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>