More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03530 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_03530  transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0369459  hitchhiker  0.0000000000000400126 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1385  LysR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3547  transcriptional regulator, LysR family  50.64 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.570181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3321  helix-turn-helix, Fis-type  51.28 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4519  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.624104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2520  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3640  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2213  transcriptional regulator, LysR family protein  29.13 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  27.3 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3454  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 314 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  27.1 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 306 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.85 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 307 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0138  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0383  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.519402  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2060  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 314 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0794  transcriptional regulator, LysR family protein  27.91 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0997  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 302 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  26.84 
 
 		 314 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  30.39 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0636  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0885  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5043  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00136  transcriptional regulator, LysR family protein  28.52 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.262446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2454  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00089328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2908  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 314 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 314 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  29.29 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0175  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 302 aa  112  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5736  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2413  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2319  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  27.55 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2409  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2824  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  25.94 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1797  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2073  transcriptional regulator, LysR family protein  28.99 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  29.9 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.67 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0881  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.995576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  27.21 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3947  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4711  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  28.98 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0484  LysR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3942  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>