More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0383 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0383  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.519402  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1094  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1325  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1735  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.73522  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2618  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3107  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454778  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 297 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1876  NodD transcription activator-related protein  33.18 
 
 		 227 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2045  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  30.61 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  32.48 
 
 		 321 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5495  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3757  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3641  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3766  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4597  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2333  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4165  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4964  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3902  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.981327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4016  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4711  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002655  LysR-like transcriptional regulator  27.36 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4022  putative LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0289175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03340  transcriptional regulator  26.57 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3321  helix-turn-helix, Fis-type  27.52 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03530  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0369459  hitchhiker  0.0000000000000400126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.92 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2520  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  29.88 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3547  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.570181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  27.8 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  27.8 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000551  transcriptional regulator  27.53 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0579  putative LysR-like regular protein  26.1 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  normal  0.164447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6977  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  26.33 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  25.17 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2908  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3640  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.525425  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8471  transcriptional regulator, LysR family  28.18 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376066  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  29.28 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0307  LysR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6632  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2222  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  26.96 
 
 		 318 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1318  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2417  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000194873  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3796  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  25.1 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3454  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  26.44 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 320 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4260  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4140  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 305 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2704  transcriptional regulator, LysR family  27.13 
 
 		 323 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.613515 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 320 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3196  nodulation protein d1  29.91 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.42 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>