More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4140 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009008  RSP_4260  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4140  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1318  LysR family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0175  LysR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0484  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 302 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  46.39 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1973  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 308 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  45.7 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5245  LysR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.204558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3640  transcriptional regulator, LysR family  46.08 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2824  LysR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 302 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0138  LysR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 311 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4324  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122962  normal  0.0785819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3679  transcriptional regulator, LysR family  45.42 
 
 		 306 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 310 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.08 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.44 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  37.42 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2223  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3947  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  32.89 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0345  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476042  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.54 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3026  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0378  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1717  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0449608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1527  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2911  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.960464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  32.46 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1258  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  33.44 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  35.88 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2020  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1414  LysR family regulatory protein  34.53 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3200  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 355 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 321 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37140  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000373718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1329  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 355 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3073  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 355 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1042  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 355 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2309  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 355 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1485  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>