More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1735 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1735  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.73522  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2618  LysR family transcriptional regulator  76.87 
 
 		 306 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1876  NodD transcription activator-related protein  73.57 
 
 		 227 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1325  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 294 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1094  LysR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3107  LysR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0383  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.519402  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  32.45 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4165  transcriptional regulator  31.5 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.2 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4339  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.33 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3757  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000551  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2333  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3766  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4597  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3902  transcriptional regulator, LysR family  30.11 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.981327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4016  transcriptional regulator, LysR family  30.11 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3641  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5495  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1318  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2045  transcriptional regulator, LysR family  30.11 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1755  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 317 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 318 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4022  putative LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 298 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0289175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  28.06 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  28.85 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2395  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 333 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0563871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  29.24 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8471  transcriptional regulator, LysR family  25.32 
 
 		 341 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  28.08 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 329 aa  122  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4964  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3640  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.525425  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  30.46 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.46 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2074  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1584  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3669  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0503  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379788  hitchhiker  0.000831033 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3988  LysR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  29.39 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  30.21 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4143  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00216178  hitchhiker  0.000662316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2696  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 316 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1595  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654422  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>