More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8471 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8471  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 341 aa  669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376066  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6977  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2704  transcriptional regulator, LysR family  37.9 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.613515 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3988  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 324 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3640  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.525425  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 342 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  35.91 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2687  LysR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.97 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  35.6 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0100  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  0.148828 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 312 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  29.28 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.48 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 306 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 320 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 320 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  30.65 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1755  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  33.54 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4339  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.76 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0175  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0334  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  33.86 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  33.12 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3909  transcriptional regulator, LysR family  33.86 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 309 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01658  transcriptional regulator transcription regulator protein  32.35 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 307 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1024  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.849003  normal  0.711621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5290  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0925  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2491  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  31.09 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5069  LysR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.256969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  33.54 
 
 		 306 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  31.33 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2441  hypothetical protein  28.35 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3896  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.590324  normal  0.42297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3624  LysR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 345 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0663919  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3530  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.22 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  32.5 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5360  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.516631  normal  0.350489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>