More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3446 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  35.14 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  35.2 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  33.11 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3385  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.521059  normal  0.192926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2991  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  31.51 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 308 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  34.47 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  34.11 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2060  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 301 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 300 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 342 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  34.81 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  34.36 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3423  LysR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0556291  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.14 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  31.91 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.34 
 
 		 300 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.44 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1755  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  158  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2696  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  31.58 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  35.93 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.88 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002079  LysR-family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 304 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2446  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0999  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.913515  normal  0.929233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 507 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2074  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>