More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0912 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 318 aa  185  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.78 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4339  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.9 
 
 		 330 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0175  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 331 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  32.69 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  34.03 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  34.03 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6126  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 314 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 323 aa  155  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4744  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  31.17 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1942  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000680141 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  33.22 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  32.03 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1550  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6019  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176233  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2055  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 325 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  30.2 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  30.49 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2448  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.9 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.42 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  33.58 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5891  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384931  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2223  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5527  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2413  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00812709 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 329 aa  149  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5736  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2243  transcription regulator protein  34.64 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1717  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0449608  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0345  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476042  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  30.48 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0378  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1527  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0484  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 328 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2409  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488071  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3026  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2319  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>