More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4108 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 310 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1751  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.81 
 
 		 304 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1164  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0213908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3679  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2824  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 302 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  34.01 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0484  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 507 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 432 aa  156  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  32.19 
 
 		 508 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2060  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32410  transcriptional regulator MexT  35.49 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2746  transcriptional regulator MexT  35.49 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 		 302 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.57 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  30.07 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  32.99 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 316 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  32.25 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.32 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  32.77 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  32.66 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0175  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64780  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>