More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1347 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 312 aa  633  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  56.35 
 
 		 325 aa  358  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 309 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 309 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 310 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 309 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 309 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 309 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 309 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 507 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  52.92 
 
 		 310 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 309 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  53.42 
 
 		 508 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0034  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  54.93 
 
 		 315 aa  339  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1164  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0213908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 394 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  48.16 
 
 		 315 aa  308  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  48.16 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  47.83 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3459  LysR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2419  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0796  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 326 aa  257  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  0.137552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3883  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2032  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 315 aa  244  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 310 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0800  LysR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.914712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0790  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 313 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2041  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 391 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000497451  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1416  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3496  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514249 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0882  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3189  transcriptional regulator  43.88 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3205  LysR family regulatory protein  43.88 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3150  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2716  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0715  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1894  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.534737  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3943  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 388 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399731  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3437  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0826083  normal  0.0701512 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0836  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0352  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139438  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4028  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 394 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4338  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 394 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3928  LysR family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 315 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0808  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0732  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635056  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5286  transcriptional regulator LysR family  39.64 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155705  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2548  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4558  LysR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  31.07 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 432 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  35.45 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  35.45 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  30.1 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.6 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.89 
 
 		 300 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3544  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2243  transcription regulator protein  34.04 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>