More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2424 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
394 aa  811    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  95.87 
 
 
316 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  82.59 
 
 
316 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  82.69 
 
 
315 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  82.69 
 
 
315 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
309 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
309 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
507 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
309 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  55.96 
 
 
508 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 
309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  54.97 
 
 
309 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  54.58 
 
 
310 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  54.58 
 
 
310 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1164  LysR family transcriptional regulator  52.82 
 
 
307 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0213908  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 
312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  45.87 
 
 
313 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3883  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 
326 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0796  transcriptional regulator, LysR family  48.66 
 
 
326 aa  292  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  0.137552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2419  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
342 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0790  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 
313 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  46.05 
 
 
325 aa  286  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2032  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 
315 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 
327 aa  280  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1416  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 
315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0034  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.81 
 
 
315 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2716  LysR family transcriptional regulator  48.66 
 
 
315 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3205  LysR family regulatory protein  48.66 
 
 
315 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0882  LysR family transcriptional regulator  48.66 
 
 
315 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3189  transcriptional regulator  48.66 
 
 
315 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1894  LysR family transcriptional regulator  48.66 
 
 
315 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.534737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3150  LysR family transcriptional regulator  48.66 
 
 
315 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0715  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 
315 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3459  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
325 aa  262  8e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
310 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0352  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 
314 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139438  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0836  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 
314 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0732  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 
315 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635056  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3928  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 
315 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0808  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 
315 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0800  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
326 aa  249  9e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.914712  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5286  transcriptional regulator LysR family  43.49 
 
 
333 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155705  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2548  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 
315 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2041  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
391 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000497451  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3943  LysR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
388 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399731  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3437  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
390 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0826083  normal  0.0701512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3496  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4028  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
394 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259688  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4338  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
394 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4558  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 
386 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.82117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  34.11 
 
 
319 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 
319 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  32.59 
 
 
310 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 
307 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
319 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3544  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
304 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.29 
 
 
300 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
306 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
306 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  31.7 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 
305 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
310 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 
316 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
309 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1973  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 
308 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  30.42 
 
 
316 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
305 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  31.7 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
306 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
306 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
317 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
307 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
307 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
307 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 
298 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 
300 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
308 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
307 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
307 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
307 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 
300 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
307 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
297 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
329 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.37 
 
 
300 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
306 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
307 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
312 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
329 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3385  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
316 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.521059  normal  0.192926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>