More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6123 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 309 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 309 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  98.71 
 
 		 309 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  99.35 
 
 		 309 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  98.71 
 
 		 508 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  99.35 
 
 		 309 aa  628  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  98.71 
 
 		 309 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  98.71 
 
 		 507 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  97.4 
 
 		 309 aa  620  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  97.08 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  97.4 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1164  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 307 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0213908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 316 aa  351  8e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  54.64 
 
 		 316 aa  348  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  53.64 
 
 		 315 aa  345  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  53.64 
 
 		 315 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  53.57 
 
 		 312 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0796  transcriptional regulator, LysR family  52.77 
 
 		 326 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  0.137552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2419  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 342 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3943  LysR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 388 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399731  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3883  LysR family transcriptional regulator  52.77 
 
 		 326 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2041  LysR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 391 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000497451  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3437  LysR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 390 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0826083  normal  0.0701512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3496  LysR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 394 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514249 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2032  LysR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  49.84 
 
 		 325 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4028  LysR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4338  LysR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 394 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0715  LysR family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1416  LysR family transcriptional regulator  54 
 
 		 315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1894  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.534737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3189  transcriptional regulator  53.59 
 
 		 315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3205  LysR family regulatory protein  53.59 
 
 		 315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2716  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0882  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3150  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0808  LysR family transcriptional regulator  53.8 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3928  LysR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 315 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0790  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0836  LysR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0352  LysR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0732  LysR family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635056  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4558  LysR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 386 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 310 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3459  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0034  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.71 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2548  LysR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  43.19 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0800  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.914712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5286  transcriptional regulator LysR family  40.52 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155705  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.78 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1755  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.99 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  33.22 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  34.58 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  34.32 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 318 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3641  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  30.32 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5495  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4964  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 297 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>