More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2419 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2419  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0796  transcriptional regulator, LysR family  87.23 
 
 		 326 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  0.137552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3883  LysR family transcriptional regulator  86.48 
 
 		 326 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2032  LysR family transcriptional regulator  75 
 
 		 315 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1416  LysR family transcriptional regulator  75.32 
 
 		 315 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0715  LysR family transcriptional regulator  73.72 
 
 		 315 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0882  LysR family transcriptional regulator  75.32 
 
 		 315 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3205  LysR family regulatory protein  75.32 
 
 		 315 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3150  LysR family transcriptional regulator  75.32 
 
 		 315 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1894  LysR family transcriptional regulator  75.32 
 
 		 315 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.534737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2716  LysR family transcriptional regulator  75.32 
 
 		 315 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3189  transcriptional regulator  75.32 
 
 		 315 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0836  LysR family transcriptional regulator  73.8 
 
 		 314 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0352  LysR family transcriptional regulator  73.8 
 
 		 314 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139438  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0808  LysR family transcriptional regulator  73.72 
 
 		 315 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3928  LysR family transcriptional regulator  73.4 
 
 		 315 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0732  LysR family transcriptional regulator  73.72 
 
 		 315 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635056  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2548  LysR family transcriptional regulator  73.4 
 
 		 315 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 507 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  54.49 
 
 		 508 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 309 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 309 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  53.8 
 
 		 310 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  53.8 
 
 		 310 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 309 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  49.15 
 
 		 316 aa  295  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  47.8 
 
 		 315 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1164  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 307 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0213908  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  47.46 
 
 		 315 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 394 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 316 aa  291  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  42.77 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2041  LysR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 391 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000497451  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3496  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 394 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4028  LysR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4338  LysR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0790  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 313 aa  242  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3943  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399731  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0034  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.14 
 
 		 315 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3437  LysR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 390 aa  238  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0826083  normal  0.0701512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3459  LysR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0800  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.914712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  37.42 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4558  LysR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5286  transcriptional regulator LysR family  37.91 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155705  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  32.69 
 
 		 309 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  32.7 
 
 		 318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 299 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  32.89 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 300 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 300 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 314 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1167  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5290  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 314 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.31 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.79 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>