More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_1894 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2032  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 315 aa  620  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3205  LysR family regulatory protein  100 
 
 		 315 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3150  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3189  transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2716  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1894  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.534737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0882  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1416  LysR family transcriptional regulator  96.19 
 
 		 315 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0715  LysR family transcriptional regulator  79.23 
 
 		 315 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3883  LysR family transcriptional regulator  74.84 
 
 		 326 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2419  LysR family transcriptional regulator  76.82 
 
 		 342 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0796  transcriptional regulator, LysR family  74.19 
 
 		 326 aa  472  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  0.137552 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0808  LysR family transcriptional regulator  78.85 
 
 		 315 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0836  LysR family transcriptional regulator  78.21 
 
 		 314 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3928  LysR family transcriptional regulator  78.27 
 
 		 315 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0352  LysR family transcriptional regulator  78.21 
 
 		 314 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0732  LysR family transcriptional regulator  78.91 
 
 		 315 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635056  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2548  LysR family transcriptional regulator  78.91 
 
 		 315 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 309 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 309 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 309 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  53.07 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 309 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 309 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  53.27 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 310 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 507 aa  315  9e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  53.59 
 
 		 508 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1164  LysR family transcriptional regulator  52.51 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0213908  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  47.99 
 
 		 316 aa  288  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  46.98 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  46.64 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 316 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3437  LysR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 390 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0826083  normal  0.0701512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3943  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399731  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3496  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 394 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2041  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 391 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000497451  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4028  LysR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4338  LysR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 394 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0790  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 313 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3459  LysR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  40.33 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0800  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 326 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.914712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0034  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.14 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 310 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4558  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 386 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82117 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5286  transcriptional regulator LysR family  36.63 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155705  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 299 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  35.02 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1167  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.33 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  32.78 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 432 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 320 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 336 aa  135  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0138  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>