More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2459 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  600  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  74.41 
 
 		 297 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  77.54 
 
 		 297 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  77.19 
 
 		 297 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  77.19 
 
 		 297 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  77.19 
 
 		 297 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  77.19 
 
 		 297 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  77.19 
 
 		 297 aa  447  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  72.64 
 
 		 298 aa  444  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  76.49 
 
 		 297 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3902  transcriptional regulator, LysR family  72.92 
 
 		 297 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.981327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4016  transcriptional regulator, LysR family  72.92 
 
 		 297 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2333  LysR family transcriptional regulator  71.93 
 
 		 297 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3757  LysR family transcriptional regulator  71.58 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4964  LysR family transcriptional regulator  72.28 
 
 		 297 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3766  LysR family transcriptional regulator  71.58 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4597  LysR family transcriptional regulator  71.58 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5495  LysR family transcriptional regulator  72.28 
 
 		 297 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3641  LysR family transcriptional regulator  71.93 
 
 		 297 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  70.27 
 
 		 298 aa  407  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2045  transcriptional regulator, LysR family  69.7 
 
 		 297 aa  398  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4022  putative LysR family transcriptional regulator  68.77 
 
 		 298 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0289175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4165  transcriptional regulator  68.95 
 
 		 297 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  60.47 
 
 		 299 aa  348  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4711  LysR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 292 aa  309  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 297 aa  242  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  46.49 
 
 		 321 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.98 
 
 		 300 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  35.28 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  35.28 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 310 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 336 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 307 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  35.12 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.99 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  34.31 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  34.02 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.88 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  35.76 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0345  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476042  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0378  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3026  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1717  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0449608  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1527  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2911  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 333 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.960464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  33.88 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  34.58 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1258  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0925  LysR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3385  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.521059  normal  0.192926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0307  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291876  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1167  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2460  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2223  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  35.45 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  35.12 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 432 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>