More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4165 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4165  transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  74.75 
 
 		 297 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  71.96 
 
 		 298 aa  424  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3902  transcriptional regulator, LysR family  73.65 
 
 		 297 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.981327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4016  transcriptional regulator, LysR family  73.65 
 
 		 297 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  70.03 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  70.18 
 
 		 297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2333  LysR family transcriptional regulator  70.88 
 
 		 297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  70.18 
 
 		 297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3766  LysR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 297 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3757  LysR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 297 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4964  LysR family transcriptional regulator  70.18 
 
 		 297 aa  401  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4597  LysR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 297 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5495  LysR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 297 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3641  LysR family transcriptional regulator  69.82 
 
 		 297 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4022  putative LysR family transcriptional regulator  69.12 
 
 		 298 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0289175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  72.3 
 
 		 298 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2045  transcriptional regulator, LysR family  71.38 
 
 		 297 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  60.14 
 
 		 299 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4711  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  49.32 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  37.22 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  36.89 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.38 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  38.57 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 314 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.81 
 
 		 309 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  35.81 
 
 		 300 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  37.7 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 309 aa  171  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  37.41 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  34.85 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 307 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2460  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3412  regulatory protein, LysR  32.21 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.366877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2248  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0456314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 320 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  37.54 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  32.99 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0307  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1447  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000494272  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1584  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2074  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>