More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4711 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4711  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  579  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2045  transcriptional regulator, LysR family  60.22 
 
 		 297 aa  319  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 297 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 297 aa  314  9e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 297 aa  314  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 297 aa  314  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 297 aa  314  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 297 aa  314  9e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  55.4 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2333  LysR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5495  LysR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3766  LysR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4597  LysR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3757  LysR family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4022  putative LysR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0289175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3641  LysR family transcriptional regulator  53.15 
 
 		 297 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4964  LysR family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 297 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  54.77 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4016  transcriptional regulator, LysR family  52.88 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3902  transcriptional regulator, LysR family  52.88 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.981327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4165  transcriptional regulator  57.55 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  50.35 
 
 		 299 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  41.54 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 318 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1550  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  36.04 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  30.03 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1167  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2248  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0456314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  30.82 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.65 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  31.01 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1318  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  33.45 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0345  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476042  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3026  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 314 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1527  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2223  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1717  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0449608  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0378  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2911  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.960464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  31.21 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  35.4 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.02 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 394 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1258  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>