More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3445 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  666    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 312 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 345 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 320 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 308 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.55 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 432 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.36 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  31.97 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  31.23 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.9 
 
 		 300 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 315 aa  168  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  32.15 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1167  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  34.44 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  32.54 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  34.44 
 
 		 319 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  38.46 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0100  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  0.148828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4744  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  31.99 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 309 aa  159  9e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.67 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  31.73 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1583  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.22 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  31.37 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0307  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  33 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1755  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3385  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.521059  normal  0.192926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  30.13 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 298 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1751  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4339  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.46 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8471  transcriptional regulator, LysR family  30.12 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376066  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>