More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2666 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  90.46 
 
 		 304 aa  557  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  90.46 
 
 		 304 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  90.79 
 
 		 304 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  90.46 
 
 		 304 aa  557  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  90.46 
 
 		 304 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  90.13 
 
 		 304 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32410  transcriptional regulator MexT  87.5 
 
 		 304 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2746  transcriptional regulator MexT  87.17 
 
 		 304 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33850  Transcriptional regulator MexT  84.14 
 
 		 314 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2183  LysR family transcriptional regulator  85.86 
 
 		 304 aa  461  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.0364497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  68.79 
 
 		 307 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 300 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  63.55 
 
 		 301 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2060  LysR family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 301 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  63.21 
 
 		 300 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  63.21 
 
 		 300 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1383  LysR family transcriptional regulator  59.67 
 
 		 308 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3102  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  58.33 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0451779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3265  transcriptional regulator, LysR family  57.67 
 
 		 309 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2460  LysR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 324 aa  340  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1584  LysR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 324 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2074  LysR family transcriptional regulator  55.18 
 
 		 307 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3669  LysR family transcriptional regulator  55.18 
 
 		 322 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  48.67 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 432 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.65 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  36.27 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1026  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 317 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  35.93 
 
 		 304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  34.01 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3025  transcriptional regulator MexT  35.14 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0902  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1036  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3517  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1973  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  32.24 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3679  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  33.22 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1762  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2045  transcriptional regulator, LysR family  38.65 
 
 		 297 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4744  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2824  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2395  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0563871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 318 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3640  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2681  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0619  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 318 aa  155  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0175  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3789  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0594  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354843  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.99 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2305  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.55 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>