More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2395 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2395  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 333 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0563871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1595  transcriptional regulator, LysR family  78.77 
 
 		 313 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0503  LysR family transcriptional regulator  79.45 
 
 		 309 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379788  hitchhiker  0.000831033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  62.54 
 
 		 319 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  62.54 
 
 		 319 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  62.62 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4744  LysR family transcriptional regulator  62.62 
 
 		 314 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1762  transcriptional regulator, LysR family  62.01 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1026  transcriptional regulator, LysR family  39.4 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3118  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 432 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  37.05 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  39.09 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 301 aa  192  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  41.31 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.69 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 304 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  34.21 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 329 aa  169  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1258  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 329 aa  169  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2060  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2223  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3026  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0345  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476042  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1717  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0449608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  34.43 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0378  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1527  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2911  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.960464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  34.62 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3517  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 314 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.89 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 345 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1036  transcriptional regulator, LysR family  32.24 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3500  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0910886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0902  transcriptional regulator, LysR family  32.24 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  34.52 
 
 		 314 aa  159  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4123  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000527418  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  35.25 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4244  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000170817  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0216  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000946054  normal  0.293728 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0214  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000152565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2073  transcriptional regulator, LysR family protein  32.67 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2744  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 309 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.546413  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  32.55 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>