More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3517 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3517  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  626  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  48.49 
 
 		 310 aa  285  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  38.8 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2060  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32410  transcriptional regulator MexT  38.54 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2746  transcriptional regulator MexT  38.54 
 
 		 304 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 300 aa  185  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.05 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  38.05 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  35.23 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  37.76 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4744  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2460  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 324 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1762  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 321 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1595  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654422  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33850  Transcriptional regulator MexT  38.71 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2395  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 333 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0563871 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.92 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1383  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0902  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1036  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2183  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.0364497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 432 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0503  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379788  hitchhiker  0.000831033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3118  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 310 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0619  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  32.43 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  31.51 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.85 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0594  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354843  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 309 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3669  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2074  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  29.33 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  35.19 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1584  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275662 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2206  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03220  Transcriptional regulator  32.29 
 
 		 347 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2681  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 308 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5290  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3789  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0794  transcriptional regulator, LysR family protein  30.98 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 332 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2020  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1414  LysR family regulatory protein  33.33 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  30.79 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2309  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3025  transcriptional regulator MexT  31.17 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3156  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3073  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1329  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0670  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3200  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1042  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  32.8 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3265  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>