More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1026 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1026  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 311 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3118  LysR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 316 aa  222  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  38.33 
 
 		 319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1762  transcriptional regulator, LysR family  37.13 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2395  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0563871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1595  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.654422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4744  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 314 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0503  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379788  hitchhiker  0.000831033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1036  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 320 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0902  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.8 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  35.14 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32410  transcriptional regulator MexT  34.88 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2746  transcriptional regulator MexT  34.88 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 345 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2060  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 300 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 318 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33850  Transcriptional regulator MexT  34.62 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2183  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.0364497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.53 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  29.55 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  28.94 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  33.56 
 
 		 304 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  31.33 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 310 aa  135  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3025  transcriptional regulator MexT  30.2 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3517  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4024  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.715762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3385  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.521059  normal  0.192926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002655  LysR-like transcriptional regulator  28.09 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03340  transcriptional regulator  27.51 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  28.37 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  29.97 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>