More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32410 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_32410  transcriptional regulator MexT  100 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.282605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2746  transcriptional regulator MexT  99.67 
 
 		 304 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 304 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  86.51 
 
 		 304 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2913  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  86.84 
 
 		 304 aa  530  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0160728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  86.51 
 
 		 304 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  86.51 
 
 		 304 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  86.51 
 
 		 304 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3040  transcriptional regulator, LysR family  86.51 
 
 		 304 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33850  Transcriptional regulator MexT  82.41 
 
 		 314 aa  457  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2183  LysR family transcriptional regulator  84.48 
 
 		 304 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.0364497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  71.48 
 
 		 307 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  69.73 
 
 		 300 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  66.22 
 
 		 301 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2060  LysR family transcriptional regulator  66.11 
 
 		 301 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  65.55 
 
 		 300 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 300 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 320 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3102  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  59.67 
 
 		 309 aa  364  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0451779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1383  LysR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 308 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3265  transcriptional regulator, LysR family  59 
 
 		 309 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.226704  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2460  LysR family transcriptional regulator  59.54 
 
 		 324 aa  345  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1584  LysR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 324 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2074  LysR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3669  LysR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  37.58 
 
 		 310 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.45 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3517  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 432 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1036  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  33.11 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0902  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 321 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1026  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  36.69 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2824  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  33.11 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3640  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2045  transcriptional regulator, LysR family  37.81 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  35.59 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  34.11 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  35.25 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3789  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3025  transcriptional regulator MexT  34.84 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0619  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0594  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3679  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 306 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.99 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2248  transcriptional regulator, LysR family  37.38 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0456314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 307 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.92 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 313 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002655  LysR-like transcriptional regulator  35.55 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2681  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1973  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03340  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  36.33 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03220  Transcriptional regulator  32.88 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 323 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2305  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 331 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>