More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1482 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  74.92 
 
 		 327 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  65.47 
 
 		 310 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0800  LysR family transcriptional regulator  58.81 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.914712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3459  LysR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  46.2 
 
 		 316 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  45.87 
 
 		 315 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  45.87 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 309 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 309 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  43.56 
 
 		 310 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 507 aa  278  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  43.89 
 
 		 508 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1164  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0213908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0790  LysR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  41.91 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0034  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.79 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0796  transcriptional regulator, LysR family  39.2 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  0.137552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3883  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2041  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 391 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000497451  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3943  LysR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 388 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399731  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2032  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 315 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2419  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3437  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0826083  normal  0.0701512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3496  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 394 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4028  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4338  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5286  transcriptional regulator LysR family  36.33 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155705  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1416  LysR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3205  LysR family regulatory protein  40.45 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2716  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3189  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0882  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493693  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3150  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1894  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.534737  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0715  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0808  LysR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3928  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0732  LysR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635056  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0836  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0352  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139438  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4558  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 386 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2548  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.9 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0175  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.37 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 315 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  34.3 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  34.08 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  32.45 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 298 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.06 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5074  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2222  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0138  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 432 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  29.68 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2206  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0324  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2551  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521467  decreased coverage  0.00635729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3544  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  27.94 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>