More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3544 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3544  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 394 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  37.89 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  31.67 
 
 		 316 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 309 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 507 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2448  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 312 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0800  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.914712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  32.34 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0796  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  0.137552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2419  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 342 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3883  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2055  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.33 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3902  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.981327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4016  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.8 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2243  transcription regulator protein  32.76 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1227  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4334  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106421  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00357  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3185  putative transcriptional regulator  31.49 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  31.48 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4964  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4508  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  0.61755 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3034  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0386168  normal  0.816732 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3766  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.203175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>