More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0790 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0790  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 309 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  49.84 
 
 		 310 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 309 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 507 aa  295  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  50 
 
 		 508 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 316 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  45.15 
 
 		 316 aa  275  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  44.15 
 
 		 315 aa  271  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  44.15 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1164  LysR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 307 aa  260  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0213908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0796  transcriptional regulator, LysR family  40.85 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  0.137552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2419  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3883  LysR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3459  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  41.53 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0800  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.914712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2032  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 315 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3150  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1894  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.534737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3205  LysR family regulatory protein  42.53 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0882  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3189  transcriptional regulator  42.53 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2716  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1416  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2041  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 391 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000497451  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0715  LysR family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  39.47 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0836  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0352  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139438  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3943  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399731  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0034  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.33 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3928  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0808  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5286  transcriptional regulator LysR family  38.89 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155705  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3496  LysR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514249 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3437  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 390 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0826083  normal  0.0701512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0732  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635056  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2548  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4338  LysR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4028  LysR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4558  LysR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82117 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.89 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 314 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 432 aa  155  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1973  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0378  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 310 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3150  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.266522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2222  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  31.88 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  34.32 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 301 aa  146  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2046  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6126  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6019  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176233  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6242  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3695  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 301 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  33.99 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3164  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6199  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2151  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 329 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.14 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>