More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1164 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1164  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0213908  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  63.4 
 
 		 310 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 309 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 309 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 309 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 309 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 309 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 309 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  63.52 
 
 		 508 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 507 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 394 aa  318  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  54.15 
 
 		 312 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  49.83 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0796  transcriptional regulator, LysR family  51.17 
 
 		 326 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  0.137552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3883  LysR family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 326 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2419  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 342 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2032  LysR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  47.87 
 
 		 325 aa  288  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0715  LysR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0034  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.17 
 
 		 315 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2716  LysR family transcriptional regulator  52.51 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0882  LysR family transcriptional regulator  52.51 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3189  transcriptional regulator  52.51 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3205  LysR family regulatory protein  52.51 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1894  LysR family transcriptional regulator  52.51 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.534737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3150  LysR family transcriptional regulator  52.51 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1416  LysR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 315 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0836  LysR family transcriptional regulator  51.51 
 
 		 314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0352  LysR family transcriptional regulator  51.51 
 
 		 314 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139438  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0808  LysR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3928  LysR family transcriptional regulator  51.17 
 
 		 315 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0732  LysR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 315 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635056  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3943  LysR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399731  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2041  LysR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000497451  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3437  LysR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0826083  normal  0.0701512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3496  LysR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0790  LysR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 313 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4028  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 394 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4338  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 394 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2548  LysR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 315 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0800  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 326 aa  252  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.914712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3459  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4558  LysR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 386 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82117 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5286  transcriptional regulator LysR family  40 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155705  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.37 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  34.59 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  34.84 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  33.01 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37140  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000373718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1751  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1550  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 333 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.67 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3385  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.521059  normal  0.192926 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 304 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 317 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 329 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  32.58 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>