More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0034 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0034  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 315 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  54.93 
 
 		 312 aa  339  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  50.65 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  47.73 
 
 		 310 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1164  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 307 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0213908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 507 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  48.05 
 
 		 508 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 309 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  46.56 
 
 		 316 aa  278  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  46.23 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  45.9 
 
 		 315 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 394 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0800  LysR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 326 aa  248  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.914712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0796  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 		 326 aa  245  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  0.137552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3883  LysR family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2419  LysR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3459  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2032  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0715  LysR family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  37.42 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0790  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0732  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635056  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0836  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0352  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 314 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139438  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1416  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3928  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.0702681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0808  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5286  transcriptional regulator LysR family  39.31 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.155705  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1894  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.534737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3189  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.576069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3205  LysR family regulatory protein  41.14 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2716  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3150  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0882  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.493693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2548  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.591994 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2041  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 391 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000497451  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3496  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 394 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514249 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4028  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4338  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3943  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399731  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3437  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0826083  normal  0.0701512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  34.11 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  33.78 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3679  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0175  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1762  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2824  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4558  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 386 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.82117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3640  transcriptional regulator, LysR family  32.86 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 308 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  32.01 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2243  transcription regulator protein  32.52 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5245  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.204558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1973  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  29.9 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3385  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.521059  normal  0.192926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  29.3 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  29.03 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1550  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2055  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5015  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5625  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0138  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2448  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>