More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0484 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0484  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  676    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1973  LysR family transcriptional regulator  56.48 
 
 		 308 aa  341  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3640  transcriptional regulator, LysR family  53.87 
 
 		 301 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5245  LysR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.204558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 302 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 309 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 302 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2824  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3679  transcriptional regulator, LysR family  50.98 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0175  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4324  LysR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122962  normal  0.0785819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1318  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  43.92 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0138  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  42.91 
 
 		 304 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4140  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 305 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4260  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 308 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 307 aa  169  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  32.23 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  32.89 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  32.8 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2305  LysR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089985 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_003296  RS01658  transcriptional regulator transcription regulator protein  33.45 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1962  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  32.26 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2230  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.474451  normal  0.423702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  36.24 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3669  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2060  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  31.13 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2666  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4139  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2994  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4978  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00475669  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2201  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00946947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4518  LysR substrate-binding  32.37 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37140  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000373718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 305 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5308  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 317 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0324  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1485  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.397513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0253  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88055 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0253  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1258  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 507 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2911  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.960464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3026  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0378  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>