More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2696 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2696  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 322 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3947  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 321 aa  222  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  41.25 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0925  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 323 aa  212  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  38.16 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0100  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  0.148828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03220  Transcriptional regulator  33.68 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  32.67 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  33.55 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3988  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4244  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000170817  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0216  transcriptional regulator, LysR family  32.24 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000946054  normal  0.293728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4123  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000527418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1036  transcriptional regulator of LysR family protein  32.8 
 
 		 313 aa  153  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0214  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000152565  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  35.37 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3805  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.829403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2704  transcriptional regulator, LysR family  30.6 
 
 		 323 aa  149  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.613515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3500  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0910886  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3734  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002079  LysR-family transcriptional regulator  33 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3932  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00420556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00455  transcriptional regulator  32.44 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2971  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00357  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0253  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 318 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.11 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1773  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0296  transcriptional regulator, LysR family protein  30.77 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35272  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.11 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001991  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 314 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0253  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3449  regulatory protein, LysR  33.87 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1167  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3262  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3940  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  31.77 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 297 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3957  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3495  regulatory protein, LysR  30.03 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268712  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2857  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2991  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  29.51 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6977  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  31.15 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  30.48 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 301 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0272  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042007 
 
 
-
 
NC_003296  RS01658  transcriptional regulator transcription regulator protein  31.44 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0342  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0324  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4139  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0274  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>