More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1094 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1094  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  627  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.154385 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1325  LysR family transcriptional regulator  94.22 
 
 		 294 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2618  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3107  LysR family transcriptional regulator  51.96 
 
 		 299 aa  289  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.454778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1735  LysR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.73522  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1876  NodD transcription activator-related protein  42.15 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0383  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.519402  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  32.59 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000551  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5495  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2094  transcription regulator protein  31.29 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3641  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3365  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8471  transcriptional regulator, LysR family  29.75 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2245  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2424  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1921  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2134  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.152417  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2222  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3905  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4022  putative LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 298 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0289175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2333  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3757  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 333 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4964  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1318  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0894  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.517609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2551  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521467  decreased coverage  0.00635729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.48 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3164  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3679  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3766  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4165  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6632  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4597  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0175  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.355822  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2074  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 507 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.834558  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1869  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0145349 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1314  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0202314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5266  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.861367  normal  0.266286 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2421  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6977  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2378  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1942  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.247873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2322  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2525  LysR family regulatory protein  29.7 
 
 		 508 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.149922  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1937  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1292  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35830  Regulatory protein, LysR-family  30.27 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1955  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1979  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0276851 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5461  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6123  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  29.45 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1157  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0192755  normal  0.578291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2956  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05338  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  27.36 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2978  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0300552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2863  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4324  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122962  normal  0.0785819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2826  transcriptional regulator MexT  29.73 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.663633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>