More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3796 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3796  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0296  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 307 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2732  LysR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 310 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.293196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2735  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 305 aa  255  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101495  normal  0.0532303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3697  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0916  LysR family transcriptional regulator  47 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0349962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1118  LysR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2347  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144865  normal  0.376852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0144  transcription regulator protein  35.67 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  33.23 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3365  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2222  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0163  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2551  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521467  decreased coverage  0.00635729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 298 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0266  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0296308 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4108  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3164  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3449  regulatory protein, LysR  30.8 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1167  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0484  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 328 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.567995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  30.33 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0253  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 314 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0639  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3376  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21080  LysR family transcriptional activator  31.33 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0307  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5308  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1227  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0296  transcriptional regulator, LysR family protein  29.94 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3196  nodulation protein d1  31.06 
 
 		 312 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3608  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0253  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1482  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0547838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3640  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0324  LysR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03220  Transcriptional regulator  32.03 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  33.12 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2640  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0866  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1318  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3932  transcriptional regulator  29.97 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00420556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3734  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457361 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 318 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4829  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2045  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3434  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3105  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.93 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5440  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002079  LysR-family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3805  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.829403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1347  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003578  LysR-family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2696  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2446  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  28.72 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2971  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2307  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.975385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0216  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000946054  normal  0.293728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4244  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000170817  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>