More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_25371 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2413  short chain dehydrogenase  51.4 
 
 		 688 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2311  short chain dehydrogenase  51.69 
 
 		 688 aa  668    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25371  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 715 aa  1458    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4827  short chain dehydrogenase  50.63 
 
 		 684 aa  674    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2693  short chain dehydrogenase  46.11 
 
 		 682 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0195  short chain dehydrogenase  44.01 
 
 		 705 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2746  short chain dehydrogenase  43.6 
 
 		 705 aa  568  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2009  short chain dehydrogenase  42.33 
 
 		 705 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.333883 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1972  short chain dehydrogenase  42.2 
 
 		 705 aa  560  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000839125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2336  short chain dehydrogenase  42.93 
 
 		 706 aa  555  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.308198  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 		 705 aa  551  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2003  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 		 705 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  41.81 
 
 		 705 aa  536  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0410  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 701 aa  526  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1970  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 		 653 aa  395  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4460  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 657 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134448  normal  0.127863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4397  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 657 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3212  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 		 689 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2454  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 		 694 aa  324  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.86013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1605  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 		 690 aa  321  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.043834 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3499  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 413 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3145  short chain dehydrogenase  42.63 
 
 		 413 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2988  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 700 aa  319  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1895  short chain dehydrogenase  33.38 
 
 		 698 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.196702  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0705  short chain dehydrogenase  31.77 
 
 		 680 aa  307  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3743  short chain dehydrogenase  37.28 
 
 		 571 aa  303  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1802  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 		 701 aa  300  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310518  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3516  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 		 664 aa  300  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390317  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2857  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  33.29 
 
 		 701 aa  296  9e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.886438 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1679  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 696 aa  287  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.962871  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6264  short chain dehydrogenase  30.58 
 
 		 703 aa  286  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0401  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 		 652 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2254  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 		 691 aa  282  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4925  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 707 aa  276  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000252534  normal  0.445415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29640  short chain dehydrogenase  32.12 
 
 		 683 aa  275  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6708  short chain dehydrogenase  30.72 
 
 		 698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3884  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 706 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4610  short chain dehydrogenase  31.24 
 
 		 707 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4215  short chain dehydrogenase  31.35 
 
 		 713 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.252283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3046  short chain dehydrogenase  33.38 
 
 		 676 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5807  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 		 698 aa  265  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402593  normal  0.0411689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2731  short chain dehydrogenase  31.53 
 
 		 729 aa  263  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3625  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 687 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.000228222  normal  0.0356352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1386  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 691 aa  261  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.88189  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3572  short chain dehydrogenase  30.31 
 
 		 698 aa  260  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.375865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05820  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  31.77 
 
 		 689 aa  260  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2381  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.87 
 
 		 677 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.932979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4810  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 		 695 aa  256  7e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4672  short chain dehydrogenase  32.15 
 
 		 679 aa  257  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174921  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0223  short chain dehydrogenase  29.94 
 
 		 699 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133149  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0429  short chain dehydrogenase  31.26 
 
 		 680 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4771  short chain dehydrogenase  30.73 
 
 		 677 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3316  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 730 aa  254  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3704  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.32 
 
 		 678 aa  254  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.701668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4390  short chain dehydrogenase  30.81 
 
 		 677 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4477  short chain dehydrogenase  30.81 
 
 		 677 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0694  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 		 726 aa  252  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.180727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3454  short chain dehydrogenase  29.58 
 
 		 730 aa  249  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.117557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6711  short chain dehydrogenase  31.53 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2592  short chain dehydrogenase  29.25 
 
 		 700 aa  248  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1303  short chain dehydrogenase  29.16 
 
 		 729 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.851428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3305  short chain dehydrogenase  30.25 
 
 		 680 aa  238  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3106  short chain dehydrogenase  30.78 
 
 		 685 aa  237  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0887  rhamnulose-1-phosphate aldolase/alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 		 684 aa  233  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2214  short chain dehydrogenase  32.3 
 
 		 707 aa  231  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2115  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 		 702 aa  230  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2436  short chain dehydrogenase  29.08 
 
 		 700 aa  216  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1724  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 705 aa  204  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616533  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 		 247 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.98 
 
 		 238 aa  100  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  32.98 
 
 		 255 aa  98.2  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.95 
 
 		 252 aa  95.9  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 261 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0274086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.8 
 
 		 252 aa  94.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 275 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 		 247 aa  93.2  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 255 aa  92.4  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 271 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.0331692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.05 
 
 		 250 aa  92  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 250 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  28.87 
 
 		 241 aa  91.3  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1358  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.15 
 
 		 255 aa  90.9  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.18 
 
 		 252 aa  90.9  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 249 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 254 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2264  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.67 
 
 		 260 aa  90.5  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.06 
 
 		 259 aa  90.5  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.8 
 
 		 248 aa  90.1  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.01 
 
 		 263 aa  90.5  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 285 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.68 
 
 		 260 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.3 
 
 		 272 aa  90.1  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  30.74 
 
 		 251 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2236  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.22 
 
 		 260 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 249 aa  89.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 		 254 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 250 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1429  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.96 
 
 		 256 aa  88.6  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.865814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 256 aa  89  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.92 
 
 		 260 aa  89  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>