More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_13011 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  100 
 
 		 737 aa  1508    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.12 
 
 		 587 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.73 
 
 		 810 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.35 
 
 		 545 aa  95.5  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 878 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.5 
 
 		 875 aa  92.8  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.7 
 
 		 725 aa  92.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 635 aa  90.9  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 635 aa  90.9  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.6 
 
 		 626 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 614 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 		 614 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 		 614 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.6 
 
 		 626 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 611 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 614 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 637 aa  87.4  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 		 366 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  24.77 
 
 		 626 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 639 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 612 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 636 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1276 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.89 
 
 		 620 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 		 689 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 792 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 465 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.03 
 
 		 1694 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 824 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 562 aa  79.7  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3035 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  20.27 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 927 aa  77.8  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26.96 
 
 		 661 aa  77.4  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 375 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  29.12 
 
 		 266 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1371 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.34 
 
 		 833 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  21.65 
 
 		 265 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 619 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.56 
 
 		 573 aa  75.5  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 543 aa  74.7  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 614 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 3145 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 762 aa  74.3  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.78 
 
 		 816 aa  73.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  30.61 
 
 		 174 aa  73.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.12 
 
 		 267 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 		 836 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 750 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 808 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 3560 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.62 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 632 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 329 aa  72  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 4079 aa  72  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.71 
 
 		 293 aa  72  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  27.16 
 
 		 681 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 1121 aa  70.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 602 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 739 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 718 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 1737 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.48 
 
 		 314 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  28.32 
 
 		 992 aa  69.7  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 612 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 583 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 4489 aa  69.3  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1827 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 754 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.53 
 
 		 564 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  25.11 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.86 
 
 		 1979 aa  68.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 754 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 589 aa  68.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  23.4 
 
 		 1764 aa  68.2  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 3172 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 750 aa  68.2  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 699 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  19.16 
 
 		 732 aa  67.8  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 789 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.35 
 
 		 745 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 758 aa  67.4  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.29 
 
 		 622 aa  67.4  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 		 3301 aa  67.4  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  22.89 
 
 		 708 aa  67  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.13 
 
 		 887 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 244 aa  67.4  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.68 
 
 		 1154 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>