More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3192 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3192  twitching motility protein  100 
 
 		 367 aa  755    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0324177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1167  twitching motility protein  41.9 
 
 		 375 aa  290  4e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.69165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  40.23 
 
 		 362 aa  282  8.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1933  twitching motility protein  40.93 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  40.12 
 
 		 349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3433  twitching motility protein  40 
 
 		 437 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3178  twitching motility protein  41.14 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0146  twitching motility protein PilT  39.17 
 
 		 386 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  39.06 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1222  twitching motility protein  38.51 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  41.32 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1254  twitching motility protein  38.51 
 
 		 376 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0245  twitching motility protein  38.79 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.292052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0199  pilus retraction protein PilT  38.61 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.035098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1130  twitching motility protein  39.53 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1448  twitching motility protein  38.86 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.991053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0410  twitching motility protein  38.42 
 
 		 378 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0758  twitching motility protein  39.61 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0178166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  40.29 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4148  twitching motility protein  37.93 
 
 		 381 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0257  twitching motility protein  38.62 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  39.71 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1214  twitching motility protein  38.25 
 
 		 396 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471762  normal  0.0158756 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1361  pilus retraction protein PilT  40.86 
 
 		 390 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.678263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0418  twitching motility protein  38.14 
 
 		 378 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  40.23 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  38.05 
 
 		 397 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01994  twitching motility protein  36.78 
 
 		 376 aa  259  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.460173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0635  twitching motility protein  38.42 
 
 		 378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2223  twitching motility protein  39.89 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3736  twitching motility protein  39.02 
 
 		 383 aa  259  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  37.61 
 
 		 374 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3631  twitching motility protein  38.73 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3368  twitching motility protein  38.89 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00118657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  39.94 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  39.08 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3160  twitching motility protein  38.76 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0343  twitching motility protein  37.46 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3450  twitching motility protein  38.89 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0803395  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  39.37 
 
 		 368 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3514  twitching motility protein  38.89 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190641  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2505  twitching motility protein  38.14 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.85199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2917  twitching motility protein  37.89 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09510  pilus retraction protein PilT  37.29 
 
 		 362 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.477048  normal  0.984681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_793  twitching mobility protein  38.33 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2406  twitching motility protein, PilT-like  37.5 
 
 		 388 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.776095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1362  Sodium:galactoside symporter  37.89 
 
 		 397 aa  256  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0220  twitching motility protein  38.48 
 
 		 383 aa  255  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05190  twitching motility protein PilU  37.36 
 
 		 382 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  39.38 
 
 		 360 aa  255  8e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0538  twitching motility protein  37.64 
 
 		 373 aa  255  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1808  twitching motility protein  37.57 
 
 		 432 aa  255  9e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.96744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0496  twitching motility protein PilU  37.36 
 
 		 387 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  39.04 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0932  twitching motility protein  36.49 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0641529  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00181  PilT1-like protein  36.65 
 
 		 358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2916  type II secretion system protein (twitching motility protein)  38.58 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.465688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2917  twitching motility protein  37.85 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  39.64 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1111  twitching motility protein  37.61 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0704  twitching motility protein  38.61 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2681  twitching motility protein  38.14 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  36.73 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1066  twitching motility protein  37.85 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2666  twitching motility protein  39.04 
 
 		 368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3877  twitching motility protein  37.29 
 
 		 378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0828189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4814  twitching motility protein  37.29 
 
 		 378 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  36.72 
 
 		 375 aa  252  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2420  pilus retraction protein PilT  38.75 
 
 		 377 aa  252  9.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2271  hypothetical protein  37.32 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  37.09 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2106  twitching motility protein  37.54 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  38.07 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0922  twitching mobility protein  38.04 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.987668  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3639  orotate phosphoribosyl transferase  35.9 
 
 		 380 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.472544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3762  Pili biogenesis ATPase  37.29 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0494  type II secretion system protein (twitching motility protein)  39.47 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0124637  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_002936  DET1255  twitching mobility protein  40.22 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  40.41 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  36.72 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1054  twitching motility protein  37.18 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000104741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4183  twitching motility protein  37.43 
 
 		 372 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.212541 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2243  hypothetical protein  37.32 
 
 		 373 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0395  twitching motility protein  37.01 
 
 		 378 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  36.72 
 
 		 346 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  38.62 
 
 		 430 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2718  twitching motility protein  36.9 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  37.5 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1211  twitching motility protein  37.46 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  38.51 
 
 		 350 aa  249  7e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  37.75 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  36.47 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2799  pilus retraction protein PilT  37.89 
 
 		 379 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  38.24 
 
 		 566 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1637  twitching motility protein  36.29 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.601857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1691  twitching motility protein  37.01 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1611  twitching motility protein  36.29 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  37.46 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1234  twitching motility protein  36.75 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00304221  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  36.36 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>