More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2057 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2057  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 252 aa  484  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  60.19 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  47.22 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5514  polysaccharide deacetylase  46.43 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.77719  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  46.55 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6669  polysaccharide deacetylase  49.07 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.422259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  45.22 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1037  polysaccharide deacetylase  46.46 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742911 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0650  polysaccharide deacetylase  42.11 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  43.98 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  32.96 
 
 		 405 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  35.67 
 
 		 417 aa  122  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  45.4 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  41.94 
 
 		 232 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  35.95 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  42.21 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 299 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  37.42 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1548  polysaccharide deacetylase  45.81 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402351  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  39.47 
 
 		 752 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  33.55 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  42.58 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  36.78 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  34.64 
 
 		 302 aa  111  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  29.89 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  34.62 
 
 		 373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  37.22 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  39.1 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  37.18 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  31.89 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  39.49 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  38.98 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  29.21 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  37.01 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  36.81 
 
 		 683 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.52 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 		 352 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.52 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 		 324 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  41.83 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  37.42 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1187  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  40.36 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1565  polysaccharide deacetylase  30.35 
 
 		 345 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.869415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7722  polysaccharide deacetylase  40.13 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  40.91 
 
 		 212 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  31.13 
 
 		 481 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 520 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  24.23 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  39.74 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  36.27 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  39.61 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0811  polysaccharide deacetylase  36.08 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.636434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0834  polysaccharide deacetylase  36.08 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 372 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1347  polysaccharide deacetylase  42.48 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0921833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4312  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 522 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0365269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  38.02 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  40.91 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  36.04 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 		 368 aa  99.4  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  28.91 
 
 		 479 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 		 404 aa  99.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  32.26 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1185  polysaccharide deacetylase  32.37 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 		 212 aa  99  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  33.76 
 
 		 199 aa  99  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  36.23 
 
 		 287 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  31.61 
 
 		 425 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  33.71 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  40.37 
 
 		 409 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  39.61 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  34.24 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  37.82 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4026  polysaccharide deacetylase  39.61 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1822  polysaccharide deacetylase  38.55 
 
 		 353 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00017451  normal  0.0392503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  34.09 
 
 		 392 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  27.96 
 
 		 479 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  37.18 
 
 		 413 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  36.42 
 
 		 285 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>