104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3042 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  393  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  49.18 
 
 		 195 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  45.99 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  45.2 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 191 aa  134  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  41.15 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 185 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  37.7 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  36.96 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  39 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  36.9 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  37.23 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 194 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  39.18 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  41.27 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 218 aa  101  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  37.43 
 
 		 188 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 192 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  33.82 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  30.39 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  36.2 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  32.9 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.56 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.99 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 281 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 276 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16600  transcriptional regulator, tetR family  34.19 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 250 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 243 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 255 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 295 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  28.26 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.33 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  40.32 
 
 		 243 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 207 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 250 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 244 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 195 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 244 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 244 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  22.52 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 225 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>