More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2997 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 239 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  40.47 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2589  regulatory protein TetR  40.7 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.09 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  40.14 
 
 		 206 aa  72  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  26.41 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  39.76 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  27.78 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  35.79 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>