More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0426 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  100 
 
 		 375 aa  767    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  73.6 
 
 		 375 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  74.67 
 
 		 375 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  75.41 
 
 		 362 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  53.7 
 
 		 377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  42.41 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  42.67 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  42.41 
 
 		 373 aa  278  8e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  43.15 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  43.24 
 
 		 358 aa  259  7e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  38.85 
 
 		 401 aa  259  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  38.79 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  39.26 
 
 		 374 aa  255  9e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  38.99 
 
 		 373 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  37.6 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  37.85 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  37.43 
 
 		 374 aa  252  7e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  39.34 
 
 		 365 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  36.56 
 
 		 378 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  37.14 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  42.03 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  37.2 
 
 		 369 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  41.23 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  37.47 
 
 		 381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  36.52 
 
 		 376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  39.19 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  37.37 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  36.77 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  36.44 
 
 		 370 aa  225  8e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  36.01 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  35.47 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  37 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.76 
 
 		 369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  39.27 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 390 aa  212  7e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  37.88 
 
 		 688 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  35.4 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  34.77 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  37.33 
 
 		 689 aa  209  9e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  39.36 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  34.82 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  36.07 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  34.93 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  36.72 
 
 		 409 aa  202  6e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  35.79 
 
 		 373 aa  199  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  35.47 
 
 		 386 aa  193  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  33.68 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  29.6 
 
 		 369 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  32.37 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  30.49 
 
 		 351 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  29.43 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.17 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  29.84 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 375 aa  119  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  27.57 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  26.29 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  28.15 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.38 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  26.9 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  28.24 
 
 		 378 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 350 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  28.38 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  24.47 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  27.05 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.17 
 
 		 361 aa  106  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 354 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  28.44 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  23.81 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  26.68 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.94 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  24.85 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.64 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.64 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 353 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.98 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  27.08 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  29.12 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.88 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.92 
 
 		 344 aa  99.8  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  24.66 
 
 		 370 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.65 
 
 		 349 aa  99.8  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  26.14 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  26.52 
 
 		 368 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.59 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  27.22 
 
 		 348 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 349 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  24.23 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  26.08 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 349 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.53 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.06 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  27.93 
 
 		 353 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  28.07 
 
 		 346 aa  93.2  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>