More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5498 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5498  diguanylate cyclase  100 
 
 		 371 aa  743    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0817101 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5583  diguanylate cyclase  56.68 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0796  diguanylate cyclase  32.14 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.121691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0112  diguanylate cyclase  32.04 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0231042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0356  diguanylate cyclase  30.66 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.174511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0345  diguanylate cyclase  30.66 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0366  diguanylate cyclase  30.66 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3822  diguanylate cyclase  33.05 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1914  diguanylate cyclase  34.62 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136216  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4529  diguanylate cyclase  35.73 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.532301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4442  diguanylate cyclase  35.73 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0351  diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4002  diguanylate cyclase  32.12 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138063  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4783  diguanylate cyclase  30.64 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.49598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2385  diguanylate cyclase  33.81 
 
 		 362 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4823  diguanylate cyclase  38.14 
 
 		 286 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4819  diguanylate cyclase  32.43 
 
 		 360 aa  135  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00140541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0679  diguanylate cyclase  32.42 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1453  diguanylate cyclase  32.49 
 
 		 371 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5649  diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1665  diguanylate cyclase  32.13 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5270  diguanylate cyclase  32.5 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5359  diguanylate cyclase  32.5 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5590  diguanylate cyclase  30 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4698  diguanylate cyclase  27.86 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5298  diguanylate cyclase  30 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4318  diguanylate cyclase  27.86 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5210  diguanylate cyclase  30 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.122629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4404  diguanylate cyclase  27.86 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1149  diguanylate cyclase  27.97 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.236865  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1122  diguanylate cyclase  27.97 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1139  diguanylate cyclase  27.97 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2056  diguanylate cyclase  32.15 
 
 		 393 aa  106  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.019716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3222  diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0257406  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1080  diguanylate cyclase  35.38 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1426  diguanylate cyclase  40.57 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3932  GGDEF domain-containing protein  36.57 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0460046  normal  0.0449819 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3566  diguanylate cyclase  37.14 
 
 		 460 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000340192  normal  0.133927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1902  diguanylate cyclase  36 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000136063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 532 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4894  diguanylate cyclase  29.1 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.067692 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3083  diguanylate cyclase  35.64 
 
 		 409 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1231  diguanylate cyclase  35.33 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3648  formamidopyrimidine-DNA glycolase  36.31 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3603  diguanylate cyclase  39.77 
 
 		 381 aa  97.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.943579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  37.36 
 
 		 532 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4428  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 383 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2725  diguanylate cyclase  29.96 
 
 		 368 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2057  diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0373556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  35.24 
 
 		 732 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 351 aa  96.3  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0119  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.91 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.969085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.33 
 
 		 781 aa  96.3  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 578 aa  95.9  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.46 
 
 		 632 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  35.65 
 
 		 736 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1174  GGDEF domain-containing protein  33.17 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2709  GGDEF domain-containing protein  34.86 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887365  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1181  diguanylate cyclase  35.03 
 
 		 482 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2946  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 575 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1934  hypothetical protein  38.46 
 
 		 634 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4429  diguanylate cyclase  41.25 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1125  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.71 
 
 		 769 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.586946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0247  diguanylate cyclase  40 
 
 		 513 aa  93.6  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0161345  hitchhiker  0.00488955 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2673  diguanylate cyclase  31.3 
 
 		 411 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.150858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2848  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 575 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1366  diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  37.89 
 
 		 587 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4369  sensor diguanylate cyclase  32.2 
 
 		 569 aa  92.8  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.399197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  37.64 
 
 		 360 aa  92.8  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1290  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 491 aa  92.8  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 821 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.15 
 
 		 578 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3048  diguanylate cyclase  32.67 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3571  diguanylate cyclase  37.14 
 
 		 610 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.8 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2867  diguanylate cyclase  36.47 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  35.5 
 
 		 611 aa  92.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1477  diguanylate cyclase  33.93 
 
 		 411 aa  92  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2770  diguanylate cyclase  37.95 
 
 		 575 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.207836  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3516  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1235  diguanylate cyclase  38.1 
 
 		 577 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  34.65 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0797  diguanylate cyclase  35.88 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1808  diguanylate cyclase  32.04 
 
 		 247 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1100  diguanylate cyclase  35.54 
 
 		 576 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0131  diguanylate cyclase  42.24 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0130  diguanylate cyclase  38.99 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922006  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5658  putative diguanylate cyclase  36.21 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0922182 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6345  diguanylate cyclase  32.89 
 
 		 506 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1695  GGDEF family protein  36.09 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.037923  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  33.67 
 
 		 712 aa  90.1  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  33.71 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3800  sensory box/GGDEF family protein  34.94 
 
 		 431 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0221299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1920  diguanylate cyclase  35.85 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0165  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.99 
 
 		 710 aa  90.1  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4111  sensory box/GGDEF family protein, putative  34.94 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2036  diguanylate cyclase  33.16 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0190259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5124  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.53 
 
 		 1015 aa  89.7  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 464 aa  89.7  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>