More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3625 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 190 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  68.25 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  68.25 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  68.25 
 
 		 192 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  46.71 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  39.89 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 218 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 211 aa  72  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  56.9 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  30.39 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  30.39 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  30.39 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 246 aa  62  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 238 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  33 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  32.05 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  32 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.58 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 250 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 258 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 245 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  28.19 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 233 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 250 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 238 aa  52  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 229 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 264 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  40.26 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 240 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 261 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  33.65 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>