More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0940 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  55.74 
 
 		 652 aa  681    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  54.14 
 
 		 685 aa  682    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  53.41 
 
 		 712 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  52.65 
 
 		 685 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 680 aa  1350    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  53.78 
 
 		 691 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  50.58 
 
 		 691 aa  621  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  47.52 
 
 		 654 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  48.14 
 
 		 709 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  41.35 
 
 		 757 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  42 
 
 		 760 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  39.61 
 
 		 723 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  39.26 
 
 		 776 aa  382  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  39.91 
 
 		 788 aa  379  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  42.16 
 
 		 747 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  38.91 
 
 		 774 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  38.91 
 
 		 774 aa  364  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 746 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  40.7 
 
 		 772 aa  353  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  41.62 
 
 		 747 aa  353  8e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  39.8 
 
 		 745 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  38.95 
 
 		 747 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  36.65 
 
 		 804 aa  348  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  38.76 
 
 		 735 aa  343  5e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  37.57 
 
 		 768 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  38.67 
 
 		 749 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  38.66 
 
 		 726 aa  307  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  36.93 
 
 		 664 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  32.82 
 
 		 686 aa  298  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  36.44 
 
 		 655 aa  277  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  36.95 
 
 		 649 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  33.11 
 
 		 649 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 		 677 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  35.42 
 
 		 653 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  33.8 
 
 		 672 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  37.28 
 
 		 680 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  32.17 
 
 		 679 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  35.03 
 
 		 716 aa  215  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 682 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  32.2 
 
 		 673 aa  177  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  32.4 
 
 		 677 aa  170  9e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  50.78 
 
 		 374 aa  134  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  31.53 
 
 		 593 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  34.12 
 
 		 650 aa  128  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  31.19 
 
 		 593 aa  127  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  34.98 
 
 		 663 aa  126  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  34.01 
 
 		 650 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  35.97 
 
 		 690 aa  126  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  32.17 
 
 		 616 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  33.78 
 
 		 678 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  33.01 
 
 		 669 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  34.87 
 
 		 655 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  27.59 
 
 		 808 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  35.41 
 
 		 657 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  35.74 
 
 		 677 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  32.78 
 
 		 657 aa  122  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  33.11 
 
 		 650 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  32.78 
 
 		 657 aa  120  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  31.49 
 
 		 655 aa  120  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 		 655 aa  120  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  32.8 
 
 		 642 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  31.23 
 
 		 659 aa  118  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  48.12 
 
 		 645 aa  118  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  49.62 
 
 		 638 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  35.76 
 
 		 651 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  35.31 
 
 		 651 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  35.31 
 
 		 651 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  35.31 
 
 		 651 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  35.31 
 
 		 651 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  31.61 
 
 		 660 aa  117  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  35.31 
 
 		 651 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  35.31 
 
 		 651 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  35.31 
 
 		 651 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  46.32 
 
 		 660 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  30.5 
 
 		 706 aa  115  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  35.33 
 
 		 628 aa  114  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  32.68 
 
 		 643 aa  114  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  33.9 
 
 		 686 aa  114  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  32.68 
 
 		 607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  35.55 
 
 		 652 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  32.88 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  32.88 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  32.88 
 
 		 650 aa  112  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  46.62 
 
 		 643 aa  112  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  32.88 
 
 		 650 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  29.11 
 
 		 663 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  33.11 
 
 		 647 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  45.71 
 
 		 648 aa  111  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  40.65 
 
 		 642 aa  111  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  39.35 
 
 		 650 aa  111  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  32.35 
 
 		 650 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 650 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  30.19 
 
 		 657 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  39.35 
 
 		 642 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 642 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  30.26 
 
 		 653 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  32.1 
 
 		 641 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 641 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  39.61 
 
 		 653 aa  108  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  32.91 
 
 		 641 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>