More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2452 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  100 
 
 
358 aa  699    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  65.43 
 
 
352 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0103  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.88 
 
 
367 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  34.47 
 
 
535 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  32.78 
 
 
473 aa  156  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  33.45 
 
 
483 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  33.45 
 
 
483 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  34.71 
 
 
528 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  33.22 
 
 
511 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  32.53 
 
 
509 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  33.55 
 
 
514 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  33.8 
 
 
483 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  32.98 
 
 
418 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  33.55 
 
 
514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0810  2-alkenal reductase  29.61 
 
 
487 aa  146  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.810469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  33.45 
 
 
501 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  35.52 
 
 
489 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  33.1 
 
 
500 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  32.42 
 
 
527 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.83 
 
 
368 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.46 
 
 
366 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  32.53 
 
 
464 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  34.23 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  30.72 
 
 
491 aa  141  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  29.77 
 
 
467 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  30.21 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  31.74 
 
 
527 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  32.3 
 
 
476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  30.89 
 
 
369 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  31.38 
 
 
513 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  30.69 
 
 
485 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  30.61 
 
 
452 aa  139  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  32.66 
 
 
418 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  30.8 
 
 
491 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  33.1 
 
 
504 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  30.48 
 
 
513 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  31.08 
 
 
461 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  30.69 
 
 
502 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  34.22 
 
 
523 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  30.48 
 
 
513 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.07 
 
 
383 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  30.69 
 
 
502 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  34.22 
 
 
524 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  32.77 
 
 
503 aa  138  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  30.69 
 
 
502 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  34.25 
 
 
466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  30.69 
 
 
502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  30.69 
 
 
502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  30.1 
 
 
497 aa  137  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  30.03 
 
 
403 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  30.69 
 
 
461 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  30.07 
 
 
520 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  30.69 
 
 
485 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  32.3 
 
 
498 aa  136  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  32.16 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  30.27 
 
 
523 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  31.44 
 
 
480 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  32.43 
 
 
481 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  30.83 
 
 
375 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  33.89 
 
 
524 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.36 
 
 
394 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5907  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.72 
 
 
424 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  31.85 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  31.01 
 
 
514 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  31.4 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  29.29 
 
 
508 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  33.22 
 
 
525 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.03 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  28.33 
 
 
374 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  30.85 
 
 
475 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  35.35 
 
 
396 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.42 
 
 
372 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  30 
 
 
502 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  32.88 
 
 
502 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  30.93 
 
 
483 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  31.03 
 
 
505 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  31.25 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  27.42 
 
 
467 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  30.9 
 
 
506 aa  133  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  34.8 
 
 
525 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.22 
 
 
428 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  31.38 
 
 
503 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  31.38 
 
 
469 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  30.27 
 
 
403 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  33.44 
 
 
497 aa  133  6e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  31.97 
 
 
508 aa  133  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  31.97 
 
 
528 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  32.41 
 
 
500 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  29.32 
 
 
485 aa  132  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  30.4 
 
 
379 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  30.12 
 
 
464 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  28.42 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  31.6 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  30.66 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  28.65 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  31.25 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  31.4 
 
 
498 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  29.36 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  29.36 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  32.93 
 
 
474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>