More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3729 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  100 
 
 		 390 aa  750    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  51.63 
 
 		 383 aa  317  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  48.95 
 
 		 385 aa  282  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  46.15 
 
 		 385 aa  282  7.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  50.54 
 
 		 374 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  33.69 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.82 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 374 aa  169  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  38.1 
 
 		 387 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.22 
 
 		 408 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  36.34 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  36.78 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  36.43 
 
 		 404 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  34.46 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.28 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  34.75 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  41.18 
 
 		 473 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.38 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.2 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.74 
 
 		 408 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  38.11 
 
 		 401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  29.69 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.84 
 
 		 410 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24.4 
 
 		 391 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  35.77 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  33.24 
 
 		 397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  32.31 
 
 		 374 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  26.4 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.65 
 
 		 383 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  34.64 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  33.96 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  32.64 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  37.36 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  37.5 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  37.17 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  27.68 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  24.04 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  32.32 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  33.15 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  30.63 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  36.04 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.92 
 
 		 418 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.26 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  37.5 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  36.1 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.96 
 
 		 422 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  34.91 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  28.37 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  31.84 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  30.53 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  37.97 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  31.09 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  34.02 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  31.28 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.72 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  31.71 
 
 		 396 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  40.96 
 
 		 457 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  35.6 
 
 		 391 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  32.99 
 
 		 398 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  32.49 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.99 
 
 		 414 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  33.43 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  35.61 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.52 
 
 		 397 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.22 
 
 		 400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  25.86 
 
 		 406 aa  120  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  32.35 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  36.74 
 
 		 429 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 405 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  35.8 
 
 		 403 aa  119  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  32.12 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.99 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  32.85 
 
 		 503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  26.65 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  31.03 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  34.85 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  28.21 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  31.18 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  25.72 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  25.72 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  36.61 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  25.72 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  25.72 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  25.72 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  32.38 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  25.72 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  25.72 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  27.51 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  25.59 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.64 
 
 		 401 aa  116  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 404 aa  116  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  32.66 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  32.32 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  23.4 
 
 		 381 aa  116  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  36.94 
 
 		 350 aa  116  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.59 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  36.06 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  26.11 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  36.29 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  26.11 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>